O objetivo do jogo é guiar um sapo até cada uma das casas vazias na parte superior da tela. O jogo começa com três sapos. Perder todos os sapos é fim de jogo. O jogador usa o joystick de 4 direções para pular o sapo uma vez. Frogger é um jogador ou dois jogadores alternando turnos.

O sapo começa na parte inferior da tela, que contém uma estrada horizontal ocupada por veículos em alta velocidade, como carros de corrida, buggies, caminhões e escavadeiras. O jogador deve guiar o sapo entre as faixas opostas do tráfego para evitar ser atropelado e perder uma vida. Depois de atravessar a rua, uma faixa central separa as duas partes principais da tela. A metade superior consiste em um rio com troncos, jacarés e tartarugas, todos se movendo horizontalmente pela tela em direções opostas. Ao pular em troncos que se movem rapidamente e nas costas de jacarés e tartarugas, o jogador pode guiar o sapo até um local seguro. O jogador deve evitar cobras, lontras e a boca aberta de jacarés. Às vezes, uma rã de cores vivas fica em um tronco e pode ser carregada para ganhar pontos de bônus. O topo da tela contém cinco "casas de sapos" e pelo menos uma está sempre aberta e disponível. Às vezes, eles contêm insetos bônus ou jacarés mortais.

Quando todos os cinco sapos estiverem em suas casas, o jogo avança para o próximo nível com dificuldade aumentada. Após cinco níveis, a dificuldade diminui brevemente e novamente aumenta progressivamente após cada nível. O cronômetro dá 30 segundos para guiar cada sapo até uma das casas e redefine para 60 tiques sempre que uma vida é perdida ou um sapo chega em casa com segurança.